افتتح برنامج درجة البكالوريوس في الهندسة الميكاترونية بجامعة عين شمس أبوابه أمام الطلاب الجامعيين في خريف عام 2004. الهندسة الميكاترونية هي مجال متعدد التخصصات يجمع بين الهندسة الميكانيكية، الإلكترونيات، علوم الكمبيوتر، وهندسة التحكم. هدف هذا البرنامج هو تخريج مهندسين ميكاترونيين قادرين على الدخول إلى الأسواق المصرية والإقليمية والدولية بمعرفتهم ومهاراتهم واحترافيتهم وأخلاقياتهم. يتمتع قسم الهندسة الميكاترونية بصلة وتفاعل كبير مع الصناعات المحلية والإقليمية والعالمية.