يوجد بكلية الهندسة جامعة عين شمس عيادة طبية تشمل عيادات: الباطنة والأسنان والدعم النفسي والطوارئ، حيث تقدم رعاية طبية لتلبية احتياجات المرضى من الطلاب، بالاضافة لتنظيم حملات للكشف المبكر عن مرض السكر ومرض الضغط وعمى الألوان للطلاب، وتقديم محاضرات الإسعافات الأولية للعاملين بالكلية، كما تستقبل حملات وزارة الصحة من: تطعيمات الكورونا وحملات الكشف المبكر عن أورام الثدي.
تقدم العيادة الطبية خدمات الكشف الطبي للطلاب الجدد كل عام، الكشف على الطلاب وتحويل حالات الطلاب للكشف بالتخصصات المختلفة، وعمل التحاليل والإشاعات اللازمة بمستشفى الطلبة، وصرف العلاج الدوائي، كما تقدم العيادة خدمة الإشراف الطبي أثناء فترة الامتحانات للطلاب.
حيث يتم الكشف وتقديم العلاج اللازم لجميع حالات الطوارئ من (طلاب، وأعضاء هيئة التدريس، وموظفين، وعمال). كما يتم التحويل بسيارة الإسعاف للحالات الحرجة من: الطلاب إلى مستشفى الطلبة، العاملين وأعضاء هيئة التدريس إلى مستشفى عين شمس التخصصي، العمال غير المثبتين إلى مستشفى الدمرداش.
تقدم عيادة الاسنان للطلاب خدمة الكشف، وعمل الحشو، وعلاج العصب، وإزالة الجير، والخلع، والأشعة على الأسنان.
يتوفر بالعيادة مقر لتقديم الدعم النفسي للطلاب الراغبين في ذلك، من خلال أستاذ دكتور متخصص منتدب من قبل الكلية وتحت الإشراف الإداري لمنظومة " ارتقاء" (EVOLUTION network for student wellbeing).
أما بالنسبة لأعضاء هيئة التدريس والعاملين فتُقدم الرعاية الصحية من خلال مستشفى عين شمس التخصصي.